Votre mission :

L’équipe de recherche s’intéresse aux mécanismes moléculaires et cellulaires des épilepsies avec malformations corticales causées par des mutations somatiques (PMID: 38710875, PMID: 36635388, PMID: 31444548). Il s’agit d’une équipe multidisciplinaire alliant la bio-informatique, la génétique, et l’établissement de modèles de la maladie in vitro et in vivo.

Objectif principal du projet : Élucider les bases moléculaires et cellulaires des malformations corticales associées à l'épilepsie.

Méthodologie :

- Détection de variants somatiques à partir de données de séquençage de l'exome (WES) et du génome (WGS) sur tissus 
- Analyse bioinformatique de données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale


MISSIONS PRINCIPALES 

En tant qu'ingénieur(e) de recherche, vous serez chargé(e) de:

- Réaliser le calling des variants somatiques sur des données de génomes en short et long reads
- Analyser la distribution de la fréquence allélique des variants (VAF) et effectuer du lignage cellulaire (lineage tracing) 
- Analyser les données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale 
- Intégrer les différents types de données (génomiques et transcriptomiques) 
- Présenter les résultats lors des réunions d'équipe et des congrès scientifiques 
- Participer à la rédaction de rapports scientifiques et de publications

Votre profil :

- Master en bioinformatique (avec expérience) ou PhD en bioinformatique/génomique
- Solide expérience en bioinformatique génomique 


Savoir-faire

- Maîtrise des langages de programmation pertinents (ex : Python, R) 
- Expérience dans l'analyse de données de séquençage à haut débit (WGS, RNA-seq) 
- Connaissance des approches d'analyse en cellule unique et de transcriptomique spatiale.
- Maîtrise de l'anglais scientifique (oral et écrit).


Savoir-être

- Capacité à travailler de manière autonome et organisée
- Faire preuve d’une rigueur scientifique
- Aisance relationnelle et à interagir avec les membres de l’équipe
- Curiosité scientifique et capacité d'adaptation à de nouvelles technologies


L’Institut du cerveau s’engage pour lutter contre toute forme de discrimination. Nous garantissons un environnement de travail inclusif et respectueux de toutes les diversités.

A propos de INSTITUT DU CERVEAU :

L'Institut du Cerveau est un établissement dédié à la recherche, à la compréhension et au traitement des troubles neurologiques et des maladies du cerveau. L'Institut unit des scientifiques de diverses disciplines, notamment la neurologie, la neurochirurgie, la neuro-imagerie, la neuropsychologie et la génétique, dans le but de collaborer sur des projets de recherche novateurs.
Les objectifs incluent la découverte de nouvelles thérapies pour traiter les maladies neurologiques telles que la maladie d'Alzheimer, la maladie de Parkinson, la sclérose en plaques, les troubles du mouvement, les troubles de l'humeur et bien d'autres. Ils cherchent également à mieux comprendre le fonctionnement du cerveau humain dans des états normaux et pathologiques.